1999-2000
Liga
| Datum | Kolo | Domaćin | Gost | Rezultat | Opširnije |
| 24.7.1999. | 1. | Croatia | Cibalia | 2:0 | Opširnije |
| 31.7.1999. | 2. | Croatia | Varteks | 4:1 | Opširnije |
| 29.8.1999. | 3. | Šibenik | Croatia | 1:1 | Opširnije |
| 7.9.1999. | 4. | Croatia | Rijeka | 1:1 | Opširnije |
| 10.9.1999. | 5. | Istra | Croatia | 0:4 | Opširnije |
| 17.9.1999. | 6. | Croatia | Vukovar '91 | 5:0 | Opširnije |
| 25.9.1999. | 7. | Zagreb | Croatia | 1:0 | Opširnije |
| 2.10.1999. | 8. | Croatia | Slaven Belupo | 5:1 | Opširnije |
| 12.10.1999. | 9. | Osijek | Croatia | 1:3 | Opširnije |
| 15.10.1999. | 10. | Croatia | Hrvatski dragovoljac | 5:0 | Opširnije |
| 23.10.1999. | 11. | Hajduk | Croatia | 1:1 | Opširnije |
| 6.11.1999. | 13. | Varteks | Croatia | 0:3 | Opširnije |
| 23.11.1999. | 14. | Croatia | Šibenik | 3:1 | Opširnije |
| 27.11.1999. | 15. | Rijeka | Croatia | 3:1 | Opširnije |
| 4.12.1999. | 16. | Croatia | Istra | 3:1 | Opširnije |
| 7.12.1999. | 12. | Cibalia | Croatia | 1:4 | Opširnije |
| 19.2.2000. | 17. | Vukovar '91 | Dinamo | 0:0 | Opširnije |
| 26.2.2000. | 18. | Dinamo | Zagreb | 2:2 | Opširnije |
| 29.2.2000. | 19. | Slaven Belupo | Dinamo | 0:5 | Opširnije |
| 4.3.2000. | 20. | Dinamo | Osijek | 3:1 | Opširnije |
| 7.3.2000. | 21. | Hrvatski dragovoljac | Dinamo | 2:4 | Opširnije |
| 11.3.2000. | 22. | Dinamo | Hajduk | 0:0 | Opširnije |
| 18.3.2000. | 23. | Dinamo | Varteks | 0:1 | Opširnije |
| 1.4.2000. | 25. | Dinamo | Hrvatski dragovoljac | 3:0 | Opširnije |
| 8.4.2000. | 26. | Vukovar '91 | Dinamo | 0:3 | Opširnije |
| 11.4.2000. | 27. | Dinamo | Istra | 2:0 | Opširnije |
| 11.4.2000. | 27. | Dinamo | Istra | 2:0 | Opširnije |
| 15.4.2000. | 28. | Šibenik | Dinamo | 2:1 | Opširnije |
| 24.4.2000. | 29. | Dinamo | Cibalia | 3:0 | Opširnije |
| 29.4.2000. | 30. | Zagreb | Dinamo | 1:2 | Opširnije |
| 6.5.2000. | 31. | Dinamo | Rijeka | 2:0 | Opširnije |
| 9.5.2000. | 32. | Osijek | Dinamo | 1:4 | Opširnije |
| 13.5.2000. | 33. | Dinamo | Hajduk | 3:1 | Opširnije |
Kup
| Datum | Kolo | Domaćin | Gost | Rezultat | Opširnije |
| 5.10.1999. | 1. | Bazinatours | Croatia | 0:10 | Opširnije |
| 10.11.1999. | 1/8 finala | Croatia | Marsonia | 4:0 | Opširnije |
| 14.3.2000. | Četvrtfinale | Rijeka | Dinamo | 1:2 | Opširnije |
| 21.3.2000. | Četvrtfinale | Dinamo | Rijeka | 2:2 | Opširnije |
| 4.4.2000. | Polufinale | Cibalia | Dinamo | 0:3 | Opširnije |
| 18.4.2000. | Polufinale | Dinamo | Cibalia | 3:1 | Opširnije |
| 2.5.2000. | Finale | Hajduk | Dinamo | 2:0 | Opširnije |
| 16.5.2000. | Finale | Dinamo | Hajduk | 1:0 | Opširnije |
Europske utakmice
| Natjecanje | Datum | Kolo | Domaćin | Gost | Rezultat | Opširnije |
| kval. Lige prvaka | 11.8.1999. | 3. pretkolo | Croatia | MTK | 0:0 | Opširnije |
| kval. Lige prvaka | 25.8.1999. | 3. pretkolo | MTK | Croatia | 0:2 | Opširnije |
| Liga prvaka | 14.9.1999. | Skupina D | Manchester United | Croatia | 0:0 | Opširnije |
| Liga prvaka | 22.9.1999. | Skupina D | Croatia | Marseille | 1:2 | Opširnije |
| Liga prvaka | 29.9.1999. | Skupina D | Croatia | Sturm Graz | 3:0 | Opširnije |
| Liga prvaka | 19.10.1999. | Skupina D | Sturm Graz | Croatia | 1:0 | Opširnije |
| Liga prvaka | 27.10.1999. | Skupina D | Croatia | Manchester United | 1:2 | Opširnije |
| Liga prvaka | 2.11.1999. | Skupina D | Marseille | Croatia | 2:2 | Opširnije |
U sezoni 1999/00. opet smo osvojili naslov prvaka i izborio plasman u Ligu prvaka, a u Kupu je Hajduk bio bolji u finalu. No najbitnija stvar u sezoni dogodila se na Valentinovo, 14. veljače 2000. godine, kada je klubu vraćeno ime Dinamo.
Drugu godinu zaredom Zagreb je gledao najbolje europske klubove na Maksimiru. Ove sezone put je bio lakši, pošto se natjecanje proširilo na 32 kluba, a bili smo nositelji u 3. pretkolu kvalifikacija protiv mađarskog MTK. Nakon što je prva utakmica završila bez golova, u drugoj je Josip Šimić s dva gola predvodio momčad do još jednog plasmana u Ligu prvaka. U skupini su čekali prošlogodišnji prvak Manchester United te francuski Marseille i austrijski Sturm Graz. Odmah na početku Modri su šokirali nogometni svijet kada su s Old Trafforda otišli neporaženi u 1. kolu skupine D. Na kraju smo završili četvrti u skupini, iako smo u zadnjoj utakmici protiv Marseilla samo nekoliko minuta prije kraja imali rezultat koji bi nas vodio do treće pozicije i Kupa UEFA.
Liga prvaka - Skupina D
| Pozicija | Klub | Utakmice | Pobjede | Neriješeni | Porazi | Zabijeni | Primljeni | Bodovi |
| 1 | Mancester Utd | 6 | 4 | 1 | 1 | 9 | 4 | 13 |
| 2 | O. Marseille | 6 | 3 | 1 | 2 | 10 | 8 | 10 |
| 3 | Sturm Graz | 6 | 2 | 0 | 4 | 7 | 12 | 6 |
| 4 | NK Croatia | 6 | 1 | 2 | 3 | 7 | 9 | 5 |
U prvenstvu su stvari krenule odlično i u prvih trinaest kola Dinamo je ostao neporažen, a prvi poraz dogodio se na Kantridi krajem studenog 1999. U nastavku smo poraženi još u tri navrata, a naslov je osvojen s četrnaest bodova prednosti nad Hajdukom. Nakon što su dva derbija završila bez pobjednika, Dinamo je u zadnjem kolu prvenstva slavio s 3-1 i tako na najljepši mogući način proslavio titulu pred svojim navijačima. Najbolji strijelac prvenstva bio je Tomo Šokota koji je postigao 21 pogodak, a u Kupu i Ligi prvaka upisao je još pet pogodaka.
Kup je pripao splitskom rivalu s ukupnih 2:1 u finalu. Na Poljudu pred 20.000 gledatelja završilo je 2:0, dok je u uzvratu zabio Igor Cvitanović, ali to nažalost nije bilo dovoljno za dvostruku krunu. Do finala smo izbacili Bazinatours, Marsoniju, Rijeku i Cibaliju.
Prva HNL
| Pozicija | Klub | Utakmice | Pobjede | Neriješeni | Porazi | Zabijeni | Primljeni | Bodovi |
| 1 | NK Croatia | 33 | 23 | 6 | 4 | 83 | 25 | 75 |
| 2 | HNK Hajduk Split | 33 | 17 | 10 | 6 | 58 | 30 | 61 |
| 3 | NK Osijek | 33 | 15 | 8 | 10 | 55 | 49 | 53 |
| 4 | HNK Rijeka | 33 | 14 | 7 | 12 | 54 | 39 | 49 |
| 5 | NK Slaven Belupo | 33 | 12 | 13 | 8 | 34 | 34 | 49 |
| 6 | HNK Cibalia | 33 | 11 | 12 | 10 | 42 | 39 | 45 |
| 7 | NK Varteks | 33 | 10 | 10 | 13 | 32 | 44 | 40 |
| 8 | NK Zagreb | 33 | 9 | 12 | 12 | 42 | 49 | 39 |
| 9 | HNK Šibenik | 33 | 8 | 10 | 15 | 33 | 50 | 34 |
| 10 | Hrv. Dragovoljac | 33 | 8 | 9 | 16 | 36 | 58 | 33 |
| 11 | NK Istra | 33 | 8 | 6 | 19 | 33 | 61 | 30 |
| 12 | NK Vukovar '91 | 33 | 7 | 9 | 17 | 32 | 56 | 30 |
